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Apothem
Pipeline-Befehle

/research-publish

/research-publish — Formatiert das Paper nach der Vorlage des Publikationsorts und stellt das Einreichungspaket zusammen (Supplement, Daten-/Code-Verfügbarkeit, Anschreiben, Ethik/Interessenkonflikt), mit einem Preprint-/DOI-Plan.

Rolle: Hauptforscher (Publikation) Pipeline-Position: Mitte der Kette

Formatiert das Paper nach der Vorlage des Publikationsorts und stellt das Einreichungspaket zusammen — Supplementmaterialien, Erklärung zur Daten-/Code-Verfügbarkeit, Anschreiben, Ethik- und Interessenkonflikterklärungen — plus einen Preprint-/Archivierungsplan mit einem DOI und einer Einreichungs-Checkliste. Der Betreiber reicht das Paket ein; der terminale Nachfolger ist /research-disseminate, der die veröffentlichte Arbeit zu ihrem Publikum trägt.

Kanonischer Aufruf

/research-publish

Mit Argumenten:

/research-publish [path/to/research-suite/]

Eingaben

Das Paper-Liefergut und _outputs/review-report.md (die Peer-Review-Überarbeitungen).

Ausgaben

Das nach dem Publikationsort formatierte Einreichungspaket an einem host-natürlichen Ort (das formatierte Manuskript + Supplementmaterialien + Erklärung zur Daten-/Code-Verfügbarkeit + Anschreiben + Ethik-/Interessenkonflikterklärungen) + _outputs/publication-record.md + eine Einreichungs-Checkliste.

Stromabwärts

/research-disseminate (nachgelagerter Konsument) — der Betreiber führt die Einreichung durch, dann trägt /research-disseminate die veröffentlichte Arbeit zu ihrem Publikum. Wenn der Publikationsort Überarbeitungen zurückgibt, /research-review gegen das überarbeitete Paper erneut ausführen, bevor das Paket neu erstellt wird.

Workflow-Phasen

Der Befehl folgt dem standardmäßigen Workflow der /research-Pipeline:

  1. Kontext laden — Das Paper und den Review-Bericht lesen.
  2. Das Sequenz-Gate verifizieren — Bestätigen, dass _outputs/review-report.md existiert; andernfalls mit Blocked: run /research-review first anhalten.
  3. Formatieren & packen — Die Vorlage des Publikationsorts anwenden; Supplement, Daten-/Code-Verfügbarkeit, Anschreiben, Ethik-/Interessenkonflikterklärungen zusammenstellen.
  4. Preprint / Archivierung planen — Den Preprint- und DOI-Plan festhalten; die Einreichungs-Checkliste erstellen.
  5. Das Übergabemanifest aktualisieren — Das Einreichungspaket und den Publikationsdatensatz festhalten.
  6. Das Paket ausgeben — Das nach dem Publikationsort formatierte Einreichungspaket + _outputs/publication-record.md.

Rigorositätsuntergrenze

Die Formatierung wahrt die gestufte Offenlegung: Bei einem doppelblinden Publikationsort werden Autor, Institution und Systemidentität auf separat eingereichte Metadaten reduziert und erst in der dafür vorgesehenen Druckfahnen-Stufe wiederhergestellt. Das Archivierungs-Deposit trägt das am Publikationsort skalierte Reproduzierbarkeitsnachweis-Paket (Daten, Code, eingefrorene Umgebung, Seeds, Hardware-Protokoll, Ergebnisse pro Instanz und Abbildungen).

Fehlermodi

SymptomUrsacheBehebung
Blocked: run /research-review firstKein Review-BerichtFühren Sie /research-review aus, um _outputs/review-report.md zu erzeugen
Unbearbeitete HIGH-ÜberarbeitungReview-Befund übersprungenBearbeiten Sie die Überarbeitung und führen Sie /research-review erneut aus
Fehlende Daten-/Code-VerfügbarkeitReproduzierbarkeitsoberfläche fehltFügen Sie vor der Einreichung die Erklärung zur Daten-/Code-Verfügbarkeit hinzu

Beispiele

# Das Einreichungspaket des Publikationsorts zusammenstellen
/research-publish path/to/research-suite/

Querverweise

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