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Apothem
Pipeline-Befehle

/research-publish

/research-publish — Formatiert das Paper nach der Vorlage des Publikationsorts und stellt das Einreichungspaket zusammen (Supplement, Daten-/Code-Verfügbarkeit, Anschreiben, Ethik/Interessenkonflikt), mit einem Preprint-/DOI-Plan.

Rolle: Hauptforscher (Publikation) Pipeline-Position: Mitte der Kette

Formatiert das Paper nach der Vorlage des Publikationsorts und stellt das Einreichungspaket zusammen — Supplementmaterialien, Erklärung zur Daten-/Code-Verfügbarkeit, Anschreiben, Ethik- und Interessenkonflikterklärungen — plus einen Preprint-/Archivierungsplan mit einem DOI und einer Einreichungs-Checkliste. Der Betreiber reicht das Paket ein; der terminale Nachfolger ist /research-disseminate, der die veröffentlichte Arbeit zu ihrem Publikum trägt.

Kanonischer Aufruf

/research-publish

Mit Argumenten:

/research-publish [--suite-name NAME]

Eingaben

Das Paper-Liefergut und _outputs/review-report.md (die Peer-Review-Überarbeitungen und seine Liste des Nicht-Beurteilten).

Ausgaben

Das nach dem Publikationsort formatierte Einreichungspaket an einem host-natürlichen Ort (das formatierte Manuskript + Supplementmaterialien + Erklärung zur Daten-/Code-Verfügbarkeit + Anschreiben + Ethik-/Interessenkonflikterklärungen) + _outputs/publication-record.md (einschließlich des datierten Registers der Regeln des Publikationsorts: jede Regel mit ihrer offiziellen Quellseite, ihrem Lesedatum und ihrer Einreichungsstufe) + eine Einreichungs-Checkliste.

Stromabwärts

/research-disseminate (nachgelagerter Konsument) — der Betreiber führt die Einreichung durch, dann trägt /research-disseminate die veröffentlichte Arbeit zu ihrem Publikum. Wenn der Publikationsort Überarbeitungen zurückgibt, /research-review gegen das überarbeitete Paper erneut ausführen, bevor das Paket neu erstellt wird.

Workflow-Phasen

Der Befehl folgt dem standardmäßigen Workflow der /research-Pipeline:

  1. Kontext laden — Das Paper und den Review-Bericht lesen; Publikationsort, Zyklus, Track und Artikeltyp festlegen und jede Regel des Publikationsorts mit ihrer offiziellen Quellseite, ihrem Lesedatum und ihrer Einreichungsstufe festhalten.
  2. Das Sequenz-Gate verifizieren — Bestätigen, dass _outputs/review-report.md existiert und seine HIGH-Überarbeitungen behoben sind (oder der Operator das Restrisiko ausdrücklich akzeptiert hat); andernfalls mit Blocked: run /research-review first anhalten.
  3. Formatieren & packen — Jede Regel des Publikationsorts mit ihrer Quellseite, ihrem Lesedatum und ihrer Einreichungsstufe mitführen, auf der unveränderten Vorlage des Publikationsorts aufbauen, Seiten und Wörter auf die Weise des Publikationsorts zählen und das kompilierte PDF prüfen; dann Supplement, Daten-/Code-Verfügbarkeit, Anschreiben sowie Ethik- und COI-Erklärungen zusammenstellen.
  4. Preprint / Archivierung planen — Den Preprint- und DOI-Plan festhalten; die Einreichungs-Checkliste erstellen.
  5. Das Übergabe-Manifest aktualisieren — Das Einreichungspaket und den Publikationsdatensatz festhalten.
  6. Das Paket ausgeben — Das nach dem Publikationsort formatierte Einreichungspaket + _outputs/publication-record.md.

Rigorositätsuntergrenze

Die Formatierung wahrt die gestufte Offenlegung: Bei einem doppelblinden Publikationsort werden Autor, Institution und Systemidentität auf separat eingereichte Metadaten reduziert und erst in der dafür vorgesehenen Druckfahnen-Stufe wiederhergestellt. Das Archivierungs-Deposit trägt das am Publikationsort skalierte Reproduzierbarkeitsnachweis-Paket (Daten, Code, eingefrorene Umgebung, Seeds, Hardware-Protokoll, Ergebnisse pro Instanz und Abbildungen). Bei einem doppelblinden Publikationsort werden das Supplement-Archiv und jedes verlinkte Repository oder jeder verlinkte Datensatz auf Identität geprüft, nicht nur das Manuskript.

Die Regeln des Publikationsorts sind belegt und stufenbezogen. Nur die eigenen offiziellen Seiten des Ziels zählen: Ein benachbarter Publikationsort, ein früherer Zyklus oder ein Schwester-Track ist nie ein Ersatz, und eine Neuerstellung für eine Überarbeitung oder für die Druckfahnen-Stufe setzt die Begrenzungen dieser Stufe durch, nicht die der Ersteinreichung. Eine Regel ohne offizielle Seite dahinter wird beim Operator erfragt und als nicht gegen den Publikationsort verifiziert markiert. Die Vorlagendateien des Publikationsorts bleiben wie herausgegeben, sodass eine lokal geschriebene Ausgangsdatei als solche gemeldet wird. Seiten und Wörter werden auf die Weise des Publikationsorts gezählt, wobei die ausgenommenen Abschnitte festgehalten werden, und jede Abbildung und Tabelle wird in der Größe und dem Format geprüft, die der Publikationsort erhält.

Fehlermodi

SymptomUrsacheBehebung
Blocked: run /research-review firstKein Review-Bericht oder offene HIGH-ÜberarbeitungenFühren Sie /research-review aus, um _outputs/review-report.md zu erzeugen, oder beheben Sie die offenen HIGH-Überarbeitungen und führen Sie /research-review erneut aus, oder akzeptieren Sie das Restrisiko ausdrücklich
Unbearbeitete HIGH-ÜberarbeitungReview-Befund übersprungenBearbeiten Sie die Überarbeitung und führen Sie /research-review erneut aus
Fehlende Daten-/Code-VerfügbarkeitReproduzierbarkeitsoberfläche fehltFügen Sie vor der Einreichung die Erklärung zur Daten-/Code-Verfügbarkeit hinzu
Regel des Publikationsorts ohne QuelleDie Regel stammt aus einem anderen Zyklus, Track oder benachbarten Publikationsort oder aus dem GedächtnisLegen Sie das Ziel fest; halten Sie für die Regel die offizielle Seite, das Lesedatum und die Stufe fest, oder fragen Sie den Operator und markieren Sie sie als nicht verifiziert
Vorlage verändertEine lokale Bearbeitung ändert die Seitengeometrie oder die Satzeinstellungen des PublikationsortsStellen Sie die Dateien des Publikationsorts wieder her und ändern Sie das Layout nur über Optionen, die die Vorlage dokumentiert

Beispiele

# Das Einreichungspaket für den Publikationsort zusammenstellen
/research-publish --suite-name <name>

Querverweise

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