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Apothem
パイプラインコマンド

/research-publish

/research-publish — 論文を投稿先のテンプレートに整形し、投稿パッケージ(補足資料、データ/コードの可用性、カバーレター、倫理/利益相反)を組み立て、プレプリント/DOI 計画を添えます。

役割: 主任研究者(公開) パイプライン上の位置: チェーン中段

論文を投稿先のテンプレートに整形し、投稿パッケージを組み立てます — 補足資料、データ/コードの可用性に関する記述、カバーレター、倫理および利益相反の宣言 — に加えて、DOI 付きのプレプリント/アーカイブ計画と投稿チェックリスト。オペレーターがパッケージを投稿します。終端の後続は /research-disseminate であり、公開された成果をその読者へと届けます。

正規の呼び出し

/research-publish

引数付き:

/research-publish [path/to/research-suite/]

入力

論文の成果物と _outputs/review-report.md(査読による改訂)。

出力

ホストにとって自然な場所にある、投稿先向けに整形された投稿パッケージ(整形された原稿+補足資料+データ/コードの可用性に関する記述+カバーレター+倫理/利益相反の宣言)+ _outputs/publication-record.md +投稿チェックリスト。

下流

/research-disseminate(下流の消費者)— オペレーターが投稿を行い、その後 /research-disseminate が公開された成果をその読者へと届けます。投稿先が改訂を返した場合は、パッケージを再構築する前に、改訂された論文に対して /research-review を再実行する。

ワークフローのフェーズ

このコマンドは標準的な /research パイプラインのワークフローに従います:

  1. コンテキストを読み込む — 論文とレビューレポートを読む。
  2. シーケンスゲートを検証する_outputs/review-report.md が存在することを確認する。存在しない場合は Blocked: run /research-review first で停止する。
  3. 整形してパッケージ化する — 投稿先のテンプレートを適用する。補足資料、データ/コードの可用性、カバーレター、倫理/利益相反の宣言を組み立てる。
  4. プレプリント/アーカイブを計画する — プレプリントと DOI の計画を記録する。投稿チェックリストを構築する。
  5. ハンドオフマニフェストを更新する — 投稿パッケージと公開記録を記録する。
  6. パッケージを発行する — 投稿先向けに整形された投稿パッケージ+ _outputs/publication-record.md

厳密性の下限

整形は段階的な開示を尊重します。二重盲検の発表先では、著者・所属機関・システムの身元は別途提出されるメタデータへと剥がされ、指定されたカメラレディ段階でのみ復元されます。アーカイブ寄託は、発表先に応じてスケールする再現性証拠パッケージ(データ、コード、固定された環境、シード、ハードウェアログ、インスタンスごとの結果、および図)を携えます。

失敗モード

症状原因回復
Blocked: run /research-review firstレビューレポートがない/research-review を実行して _outputs/review-report.md を生成する
未対応の HIGH 改訂レビューの指摘を飛ばした改訂に対応して /research-review を再実行する
データ/コードの可用性が欠落再現性のための面が存在しない投稿前にデータ/コードの可用性に関する記述を追加する

# 投稿先の投稿パッケージを組み立てる
/research-publish path/to/research-suite/

相互参照

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