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Apothem
Référence

Serveurs MCP

Configuration des serveurs Model Context Protocol — propriété de l'opérateur et enregistrés via le mécanisme MCP natif de chaque outil ; quelques adaptateurs projettent l'inventaire MCP du profil partagé, les autres n'écrivent aucune entrée de serveur.

Les serveurs Model Context Protocol (MCP) sont la propriété de l'opérateur. Apothem porte l'inventaire MCP dans le profil partagé (mcp_servers). Un adaptateur dont l'outil conserve ses serveurs MCP dans un fichier de configuration qu'Apothem écrit déjà projette cet inventaire dans ce fichier ; tous les autres adaptateurs n'écrivent aucune entrée de serveur, et l'enregistrement des serveurs via l'outil reste à votre charge.

Quels adaptateurs projettent l'inventaire

Le tableau ci-dessous est généré à partir de la cellule de capacité mcp_servers du registre des environnements pour chaque adaptateur.

HarnessMCP inventoryNote
Antigravity (antigravity)Not projected (discovery-pending)MCP lives in an operator-owned config surface (file / CLI / service state); the adapter names it but authors no entries.
Claude Code (claude-code)Not projected (discovery-pending)MCP lives in an operator-owned config surface (file / CLI / service state); the adapter names it but authors no entries.
CodeBuddy (codebuddy)Not projected (discovery-pending)MCP lives in an operator-owned config surface (file / CLI / service state); the adapter names it but authors no entries.
Codex (codex)Not projected (discovery-pending)MCP lives in an operator-owned config surface (file / CLI / service state); the adapter names it but authors no entries.
Cursor (cursor)Not projected (discovery-pending)MCP lives in an operator-owned config surface (file / CLI / service state); the adapter names it but authors no entries.
Gemini CLI (gemini-cli)Not projected (discovery-pending)MCP lives in an operator-owned config surface (file / CLI / service state); the adapter names it but authors no entries.
GitHub Copilot (github-copilot)Not projected (unsupported)Copilot MCP is configured in repository settings, the IDE, the Copilot CLI, or a custom agent profile; the adapter authors none of them.
GLM (Z.ai) (glm)Not projected (unsupported)GLM is a model backend configured via Anthropic/OpenAI-compatible env; it exposes no native MCP-server surface.
Hermes (hermes)Projected: written into the tool's MCP config—
Kimi Code (kimi-code)Not projected (discovery-pending).kimi-code/mcp.json is the recognized operator-owned MCP surface; Apothem names it but defers authoring entries.
Kiro (kiro)Not projected (discovery-pending)MCP lives in an operator-owned config surface (file / CLI / service state); the adapter names it but authors no entries.
Open-Claw (open-claw)Not projected (unsupported)Open-Claw MCP lives in the mcp.servers config block managed via the openclaw mcp CLI; the adapter authors no entries.
OpenCode (opencode)Projected: written into the tool's MCP config—
Qwen Code (qwen-code)Projected: written into the tool's MCP config—
Trae (trae)Not projected (discovery-pending)MCP lives in an operator-owned config surface (file / CLI / service state); the adapter names it but authors no entries.
Windsurf (windsurf)Not projected (discovery-pending)MCP lives in an operator-owned config surface (file / CLI / service state); the adapter names it but authors no entries.
Zed (zed)Not projected (discovery-pending)MCP lives in an operator-owned config surface (file / CLI / service state); the adapter names it but authors no entries.

Où les serveurs MCP s'enregistrent

Chaque outil enregistre les serveurs MCP via son propre mécanisme natif, et Apothem respecte cette surface au lieu de l'écraser. Sur Claude Code, les serveurs s'enregistrent avec claude mcp add dans ~/.claude.json (portée utilisateur ou locale) et dans un .mcp.json au niveau du projet ; l'adaptateur Claude Code n'écrit aucun de ces deux fichiers, et les paramètres Claude Code gérés par Apothem ne portent jamais de bloc mcpServers.

Donner à un auxiliaire l'accès aux serveurs MCP

Les agents de recherche en lecture seule (research-scout, citation-auditor) sont livrés avec une liste tools explicite composée de Read, Glob, Grep, WebSearch, WebFetch. Claude Code n'admet un outil MCP dans la liste explicite d'un sous-agent que lorsqu'une entrée nomme le serveur, sous la forme mcp__<server>__*. La clé agent_mcp_servers du profil nomme ces serveurs par agent :

agent_mcp_servers:
  research-scout:
    - "your-scholarly-server"
  citation-auditor:
    - "your-scholarly-server"

L'installation de Claude Code ajoute une entrée mcp__<server>__* par serveur nommé à la ligne tools de chaque agent listé, et ne modifie aucun autre agent ni aucune autre ligne. Sans la clé, chaque agent conserve la liste simple, de sorte qu'aucun agent n'atteint un outil MCP. Écrivez chaque nom de serveur tel que /mcp l'affiche. Claude Code écrit : et . sous la forme _ dans les noms d'outils, de sorte que l'installation rend le serveur plugin:bio-research:biorxiv sous la forme mcp__plugin_bio-research_biorxiv__*. Un nom contient des lettres, des chiffres, -, _, : et ., commence et se termine par une lettre ou un chiffre, et ne contient jamais deux caractères parmi _, : et . à la suite (l'entrée rendue contiendrait un __) ; *, les espaces et tout autre caractère sont rejetés. Un octroi nomme chaque outil de ce serveur, y compris ceux qui écrivent, n'octroyez donc qu'un serveur auquel vous faites confiance pour des recherches ; les instructions des agents les limitent aux recherches, mais l'environnement n'applique que les noms que vous listez. Un octroi pour un agent qui n'existe pas, ou pour un agent sans liste tools explicite, est signalé et ignoré. Une surcharge par environnement sous harnesses.claude-code s'ajoute aux listes partagées.

L'octroi s'applique à l'installation par le moteur (apothem install) sur Claude Code et sur Gemini CLI. Sur Gemini CLI, l'installation ajoute une entrée mcp_<server>_* par serveur nommé à la liste d'autorisation tools de l'agent listé, par exemple mcp_your-scholarly-server_*, et ne modifie aucun autre agent ni aucune autre ligne. Gemini CLI nomme chaque outil MCP mcp_{serverName}_{toolName} et lit le serveur dans le texte jusqu'au premier trait de soulignement après mcp_, de sorte qu'un nom de serveur contenant un trait de soulignement ne peut pas y être adressé. Apothem n'écrit un octroi Gemini CLI que pour un nom composé de lettres, de chiffres et de - : un nom contenant un trait de soulignement, un deux-points ou un point est valide pour Claude Code mais est ignoré pour Gemini CLI et signalé, jamais réécrit en un autre nom. Un agent qui atteint déjà chaque serveur MCP (pas de liste tools, ou une liste qui contient mcp_*) est laissé inchangé et signalé. Gemini CLI n'a pas de liste de refus, de sorte qu'un serveur que nomme le propre disallowedTools de l'agent ne reçoit aucune entrée et est signalé : le refus l'emporte, comme sur Claude Code. L'octroi Gemini lit les listes partagées agent_mcp_servers et la surcharge harnesses.gemini-cli, pas celle de harnesses.claude-code. Les autres environnements ignorent la clé : Qwen Code ne documente aucune entrée par serveur pour tools ; OpenCode contrôle les outils par des permissions ; Codex et Antigravity n'émettent aucune liste d'outils.

Le plugin Claude Code est assemblé sans profil, de sorte que ses deux agents conservent la liste simple. Pour leur donner accès à des connecteurs sans modifier les fichiers du plugin, définissez votre propre agent de niveau utilisateur dans ~/.claude/agents/, sous un nom de votre choix, qui porte la même liste tools en lecture seule plus les entrées mcp__<server>__* que vous souhaitez.

Ajouter un serveur

Enregistrez un serveur via le mécanisme natif de votre outil ; la forme d'entrée canonique est une clé sous mcpServers :

{
  "mcpServers": {
    "filesystem": {
      "command": "npx",
      "args": ["-y", "@modelcontextprotocol/server-filesystem", "/some/path"]
    }
  }
}

Le runtime de l'outil charge les serveurs enregistrés au démarrage de la session ; redémarrez l'outil pour prendre en compte les nouveaux serveurs.

Convention de nommage

Les outils MCP se présentent à l'assistant sous la forme mcp__<server>__<tool> selon la convention standard de nommage des outils MCP de l'outil.

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