/research-publish
/research-publish — Formate l'article selon le modèle de la revue et assemble le dossier de soumission (matériel supplémentaire, disponibilité des données/du code, lettre de présentation, éthique/conflit d'intérêts), avec un plan de préprint/DOI.
Rôle : Investigateur principal (publication) Position dans le pipeline : milieu de chaîne
Formate l'article selon le modèle de la revue et assemble le dossier de soumission — matériel supplémentaire, déclaration de disponibilité des données / du code, lettre de présentation, déclarations d'éthique et de conflit d'intérêts — ainsi qu'un plan de préprint / d'archivage avec un DOI et une liste de contrôle de soumission. L'opérateur soumet le dossier ; le successeur terminal est /research-disseminate, qui porte le travail publié vers son public.
Invocation canonique
/research-publishAvec des arguments :
/research-publish [path/to/research-suite/]Entrées
Le livrable de l'article et _outputs/review-report.md (les révisions de l'évaluation par les pairs).
Sorties
Le dossier de soumission formaté pour la revue à un emplacement naturel de l'hôte (le manuscrit formaté + le matériel supplémentaire + la déclaration de disponibilité des données / du code + la lettre de présentation + les déclarations d'éthique / de conflit d'intérêts) + _outputs/publication-record.md + une liste de contrôle de soumission.
En aval
/research-disseminate (consommateur en aval) — l'opérateur effectue la soumission, puis /research-disseminate porte le travail publié vers son public. Lorsque la revue retourne des révisions, réexécutez /research-review sur l'article révisé avant de reconstruire le dossier.
Phases du flux de travail
La commande suit le flux de travail standard du pipeline /research :
- Charger le contexte — Lire l'article et le rapport d'évaluation.
- Vérifier la Porte de séquence — Confirmer que
_outputs/review-report.mdexiste ; sinon, s'arrêter avecBlocked: run /research-review first. - Formater et empaqueter — Appliquer le modèle de la revue ; assembler le matériel supplémentaire, la disponibilité des données/du code, la lettre de présentation, les déclarations d'éthique / de conflit d'intérêts.
- Planifier le préprint / l'archivage — Enregistrer le plan de préprint et de DOI ; construire la liste de contrôle de soumission.
- Mettre à jour le manifeste de transfert — Enregistrer le dossier de soumission et le registre de publication.
- Émettre le dossier — Le dossier de soumission formaté pour la revue +
_outputs/publication-record.md.
Seuil de rigueur
Le formatage honore la divulgation par étapes : pour un lieu de publication en double aveugle, l'identité de l'auteur, de l'institution et du système est réduite à des métadonnées soumises séparément et restaurée seulement à l'étape désignée de version prête pour l'impression. Le dépôt d'archivage porte le dossier de preuves de reproductibilité mis à l'échelle du lieu de publication (données, code, environnement épinglé, graines, journal du matériel, résultats par instance et figures).
Modes de défaillance
| Symptôme | Cause | Récupération |
|---|---|---|
| Blocked: run /research-review first | Aucun rapport d'évaluation | Exécutez /research-review pour produire _outputs/review-report.md |
| Révision HIGH non traitée | Constat d'évaluation ignoré | Traitez la révision et réexécutez /research-review |
| Disponibilité des données/du code manquante | Surface de reproductibilité absente | Ajoutez la déclaration de disponibilité des données / du code avant la soumission |
Exemples
# Assembler le dossier de soumission de la revue
/research-publish path/to/research-suite/Références croisées
/research-review
/research-review — Critique adversariale de niveau évaluation par les pairs de l'article : une grille de notation de l'évaluateur à sept axes (nouveauté, rigueur, reproductibilité, clarté, éthique, revue statistique, conformité aux directives de rapport) plus une liste de révisions obligatoires triée par gravité.
/research-disseminate
/research-disseminate — Pilote la diffusion et l'impact post-acceptation : annonce du preprint, artefacts publics, dépôt d'archivage FAIR, suivi des altmetrics, la boucle de réponse / révision des relecteurs et le parcours de l'étape 2 du rapport enregistré — l'étape terminale du flux /research, après /research-publish.