流水线命令
/research-publish
/research-publish——将论文格式化为期刊模板并组装投稿包（补充材料、数据／代码可用性、投稿信、伦理／利益冲突声明），并附带预印本／DOI 计划。
角色： 首席研究者（发表） 流水线位置： 链路中段
将论文格式化为期刊模板并组装投稿包——补充材料、数据／代码可用性声明、投稿信、伦理与利益冲突声明——外加带 DOI 的预印本／归档计划和一份投稿清单。由操作者投递投稿包；终端后继是 /research-disseminate，它将已发表的工作传递给其受众。
规范调用
/research-publish带参数：
/research-publish [path/to/research-suite/]输入
论文交付物和 _outputs/review-report.md（同行评审修订）。
输出
宿主自然位置的期刊格式化投稿包（格式化的稿件＋补充材料＋数据／代码可用性声明＋投稿信＋伦理／利益冲突声明）＋ _outputs/publication-record.md ＋一份投稿清单。
下游
/research-disseminate（下游消费者）——由操作者执行投稿，随后 /research-disseminate 将已发表的工作传递给其受众。当期刊返回修订意见时，先对修订后的论文重新运行 /research-review，再重建投稿包。
工作流阶段
该命令遵循标准的 /research 流水线工作流：
- 加载上下文——读取论文和评审报告。
- 验证序列门——确认
_outputs/review-report.md存在；否则以Blocked: run /research-review first停止。 - 格式化与打包——应用期刊模板；组装补充材料、数据／代码可用性、投稿信、伦理／利益冲突声明。
- 规划预印本／归档——记录预印本和 DOI 计划；构建投稿清单。
- 更新交接清单——记录投稿包和发表记录。
- 发出投稿包——期刊格式化的投稿包＋
_outputs/publication-record.md。
严谨性强制底线
格式化尊重分阶段披露：对于双盲发表场所，作者、机构和系统身份被剥离至单独提交的元数据，仅在指定的清样阶段才恢复。归档存放携带随发表场所伸缩的可复现性证据包（数据、代码、固定的环境、随机种子、硬件日志、逐实例结果和图表）。
失败模式
| 症状 | 原因 | 恢复 |
|---|---|---|
| Blocked: run /research-review first | 没有评审报告 | 运行 /research-review 以产出 _outputs/review-report.md |
| 未处理的 HIGH 级修订 | 跳过了评审发现 | 处理该修订并重新运行 /research-review |
| 缺少数据／代码可用性 | 缺失可复现性界面 | 在投稿前补上数据／代码可用性声明 |
示例
# 组装期刊投稿包
/research-publish path/to/research-suite/