/research-publish

/research-publish — Форматирует статью по шаблону площадки и собирает пакет для подачи (дополнительные материалы, доступность данных/кода, сопроводительное письмо, этика/конфликт интересов), с планом препринта/DOI.

Роль: Главный исследователь (публикация) Позиция в конвейере: середина цепочки

Форматирует статью по шаблону площадки и собирает пакет для подачи — дополнительные материалы, заявление о доступности данных / кода, сопроводительное письмо, заявления об этике и конфликте интересов — плюс план препринта / архивирования с DOI и контрольный список подачи. Оператор подаёт пакет; конечный преемник — /research-disseminate, который доносит опубликованную работу до её аудитории.

Каноническое обращение

/research-publish

С аргументами:

/research-publish [path/to/research-suite/]

Входные данные

Поставляемая статья и _outputs/review-report.md (правки рецензирования).

Выходные данные

Отформатированный по площадке пакет для подачи в естественном для хоста месте (отформатированная рукопись + дополнительные материалы + заявление о доступности данных / кода + сопроводительное письмо + заявления об этике / конфликте интересов) + _outputs/publication-record.md + контрольный список подачи.

Ниже по потоку

/research-disseminate (потребитель ниже по потоку) — подачу выполняет оператор, затем /research-disseminate доносит опубликованную работу до её аудитории. Когда площадка возвращает правки, снова запустите /research-review против исправленной статьи перед пересборкой пакета.

Фазы рабочего процесса

Команда следует стандартному рабочему процессу конвейера /research:

Загрузить контекст — Прочитать статью и отчёт о рецензировании.
Проверить Шлюз последовательности — Подтвердить, что _outputs/review-report.md существует; иначе остановиться с Blocked: run /research-review first.
Отформатировать и упаковать — Применить шаблон площадки; собрать дополнительные материалы, доступность данных/кода, сопроводительное письмо, заявления об этике / конфликте интересов.
Спланировать препринт / архивирование — Зафиксировать план препринта и DOI; составить контрольный список подачи.
Обновить манифест передачи — Зафиксировать пакет для подачи и запись о публикации.
Выпустить пакет — Отформатированный по площадке пакет для подачи + _outputs/publication-record.md.

Нижняя граница строгости

Форматирование чтит поэтапное раскрытие: для площадки с двойным слепым рецензированием идентичность автора, учреждения и системы вынесена в отдельно подаваемые метаданные и восстанавливается лишь на назначенном этапе готовой к печати версии. Архивный депозит несёт масштабированный под площадку пакет доказательств воспроизводимости (данные, код, закреплённое окружение, семена, журнал оборудования, результаты по экземплярам и рисунки).

Режимы отказа

Симптом	Причина	Восстановление
Blocked: run /research-review first	Нет отчёта о рецензировании	Запустите `/research-review`, чтобы получить `_outputs/review-report.md`
Неустранённая правка HIGH	Замечание рецензирования пропущено	Устраните правку и снова запустите `/research-review`
Отсутствует доступность данных/кода	Поверхность воспроизводимости отсутствует	Добавьте заявление о доступности данных / кода перед подачей

Примеры

# Собрать пакет для подачи на площадку
/research-publish path/to/research-suite/