/research-publish
/research-publish — Форматирует статью по шаблону площадки и собирает пакет для подачи (дополнительные материалы, доступность данных/кода, сопроводительное письмо, этика/конфликт интересов), с планом препринта/DOI.
Роль: Главный исследователь (публикация) Позиция в конвейере: середина цепочки
Форматирует статью по шаблону площадки и собирает пакет для подачи — дополнительные материалы, заявление о доступности данных / кода, сопроводительное письмо, заявления об этике и конфликте интересов — плюс план препринта / архивирования с DOI и контрольный список подачи. Оператор подаёт пакет; конечный преемник — /research-disseminate, который доносит опубликованную работу до её аудитории.
Каноническое обращение
/research-publishС аргументами:
/research-publish [--suite-name NAME]Входные данные
Поставляемая статья и _outputs/review-report.md (правки рецензирования и его список неоценённых).
Выходные данные
Отформатированный по площадке пакет для подачи в естественном для хоста месте (отформатированная рукопись + дополнительные материалы + заявление о доступности данных / кода + сопроводительное письмо + заявления об этике / конфликте интересов) + _outputs/publication-record.md (включая датированный реестр правил площадки: каждое правило с его официальной страницей-источником, датой прочтения и этапом подачи) + контрольный список подачи.
Ниже по потоку
/research-disseminate (потребитель ниже по потоку) — подачу выполняет оператор, затем /research-disseminate доносит опубликованную работу до её аудитории. Когда площадка возвращает правки, снова запустите /research-review против исправленной статьи перед пересборкой пакета.
Фазы рабочего процесса
Команда следует стандартному рабочему процессу конвейера /research:
- Загрузить контекст — Прочитать статью и отчёт о рецензировании; закрепить площадку, цикл, трек и тип статьи и записать каждое правило площадки с его официальной страницей-источником, датой прочтения и этапом подачи.
- Проверить Шлюз последовательности — Подтвердить, что
_outputs/review-report.mdсуществует и что его правки уровня HIGH устранены (или оператор явно принял остаточный риск); иначе остановиться сBlocked: run /research-review first. - Оформить и упаковать — Перенести каждое правило площадки с его страницей-источником, датой прочтения и этапом подачи, строить на нетронутом шаблоне площадки, считать страницы и слова так, как это делает площадка, и проверить скомпилированный PDF; затем собрать дополнительные материалы, доступность данных/кода, сопроводительное письмо, заявления об этике / конфликте интересов.
- Спланировать препринт / архивирование — Зафиксировать план препринта и DOI; составить контрольный список подачи.
- Обновить манифест передачи — Зафиксировать пакет подачи и запись о публикации.
- Выпустить пакет — оформленный по площадке пакет подачи +
_outputs/publication-record.md.
Нижняя граница строгости
Форматирование чтит поэтапное раскрытие: для площадки с двойным слепым рецензированием идентичность автора, учреждения и системы вынесена в отдельно подаваемые метаданные и восстанавливается лишь на назначенном этапе готовой к печати версии. Архивный депозит несёт масштабированный под площадку пакет доказательств воспроизводимости (данные, код, закреплённое окружение, семена, журнал оборудования, результаты по экземплярам и рисунки). Для площадки с двойным слепым рецензированием на идентичность проверяются дополнительный архив и каждый связанный репозиторий или набор данных, а не только рукопись.
Правила площадки имеют источник и привязаны к этапу. Учитываются только собственные официальные страницы целевой площадки: соседняя площадка, более ранний цикл или родственный трек никогда не служат заменой, а пересборка для правки или для готовой к печати версии применяет ограничения этого этапа, а не ограничения первоначальной подачи. Правило, за которым не стоит официальная страница, запрашивается у оператора и помечается как не проверенное по площадке. Файлы шаблона площадки остаются в выпущенном виде, поэтому локально написанный стартовый файл сообщается как таковой. Страницы и слова считаются так, как это делает площадка, с записью исключённых разделов, и каждый рисунок и таблица проверяются в том размере и формате, в котором их получает площадка.
Режимы отказа
| Симптом | Причина | Восстановление |
|---|---|---|
| Blocked: run /research-review first | Нет отчёта о рецензировании или открыты правки уровня HIGH | Запустите /research-review, чтобы получить _outputs/review-report.md, либо устраните открытые правки HIGH и снова запустите /research-review, либо явно примите остаточный риск |
| Неустранённая правка HIGH | Замечание рецензирования пропущено | Устраните правку и снова запустите /research-review |
| Отсутствует доступность данных/кода | Поверхность воспроизводимости отсутствует | Добавьте заявление о доступности данных / кода перед подачей |
| Правило площадки без источника | Правило взято из другого цикла, трека или соседней площадки либо из памяти | Закрепите цель; запишите для правила официальную страницу, дату прочтения и этап либо спросите оператора и пометьте его как не проверенное |
| Шаблон изменён | Локальная правка меняет геометрию страницы или настройки шрифта площадки | Восстановите файлы площадки и меняйте макет только через параметры, которые документирует шаблон |
Примеры
# Собрать пакет для подачи на площадку
/research-publish --suite-name <name>Перекрёстные ссылки
/research-review
/research-review — Состязательная критика статьи на уровне рецензирования: семиосевая оценочная карта рецензента (новизна, строгость, воспроизводимость, ясность, этика, статистическая проверка, соответствие правилам отчётности) плюс отсортированный по серьёзности список обязательных правок.
/research-disseminate
/research-disseminate — Управляет распространением и влиянием после принятия: анонс препринта, публичные артефакты, депонирование в FAIR-архив, отслеживание altmetrics, цикл ответа рецензентам / доработки и путь стадии 2 зарегистрированного отчёта — завершающий этап конвейера /research, после /research-publish.